Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc144bE9PVZ3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms