Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc62E9PVD1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms