Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc17E9PVB5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms