Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms