Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit3bE9PV48 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms