Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clca3bE9PUL3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms