Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cngb1E1AZ71 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cngb1E1AZ71 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms