Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Klhl3E0CZ16 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl3E0CZ16 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms