Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5478D3Z6R0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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