Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc6D3YZP9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc6D3YZP9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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