Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm6685D3YYP3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms