Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SafbD3YXK2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms