Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smok3bC0HKC9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smok3bC0HKC9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms