Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms