Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud7bB2RUR8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms