Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf3B2RUQ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms