Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AU015836B2RUM3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AU015836B2RUM3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms