Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PtprbB2RU80 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PtprbB2RU80 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PtprbB2RU80 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PtprbB2RU80 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PtprbB2RU80 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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