Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf518bB2RRE4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf518bB2RRE4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms