Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf3B2RQG2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf3B2RQG2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms