Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm2012B1B0R1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm2012B1B0R1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms