Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd5B1AYB6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd5B1AYB6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms