Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NhsB1AV60 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NhsB1AV60 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms