Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxa1B1AUS7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxa1B1AUS7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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