Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik3B1AS29 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms