Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem238A9JSM3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms