Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M5A7VMS3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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