Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn3aA2ASI5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scn3aA2ASI5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms