Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttll9A2APC3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms