Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc163A2AGD7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc163A2AGD7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms