Protein–RNA interactions for Protein: A2AED3

Fndc7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc7A2AED3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fndc7A2AED3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms