Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul4bA2A432 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms