Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms