Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms