Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv26A0A0B4J1P5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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