Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trbv30A0A0B4J1P1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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