Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv19A0A0B4J1H4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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