Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zcchc8Q9CYA6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zcchc8Q9CYA6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zcchc8Q9CYA6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zcchc8Q9CYA6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc8Q9CYA6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms