Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skap2Q3UND0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Skap2Q3UND0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skap2Q3UND0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skap2Q3UND0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skap2Q3UND0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms