Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Yy1Q00899 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Yy1Q00899 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Yy1Q00899 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Yy1Q00899 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Yy1Q00899 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Yy1Q00899 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms