Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Depdc5P61460 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Depdc5P61460 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Depdc5P61460 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Depdc5P61460 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Depdc5P61460 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Depdc5P61460 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Depdc5P61460 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Depdc5P61460 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Depdc5P61460 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Depdc5P61460 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Depdc5P61460 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Depdc5P61460 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Depdc5P61460 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Depdc5P61460 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms