Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pex2P55098 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pex2P55098 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pex2P55098 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pex2P55098 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pex2P55098 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex2P55098 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex2P55098 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pex2P55098 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex2P55098 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex2P55098 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pex2P55098 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pex2P55098 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex2P55098 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex2P55098 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex2P55098 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex2P55098 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex2P55098 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms