Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SP140Q13342 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SP140Q13342 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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SP140Q13342 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SP140Q13342 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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