Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3550W4VSN7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms