Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csmd2V9GX34 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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