Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd4Q9Z2D7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd4Q9Z2D7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms