Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdpk1Q9Z2A0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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