Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NfkbiaQ9Z1E3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms