Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms