Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf13bQ9WU72 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms